Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS4Q9BT78 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS4Q9BT78 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms