Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2Q9BSQ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCM2Q9BSQ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCM2Q9BSQ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCM2Q9BSQ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCM2Q9BSQ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms