Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VGLL1Q99990 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms