Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CITED1Q99966 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms