Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN18Q99952 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN18Q99952 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN18Q99952 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms