Protein–RNA interactions for Protein: Q99729

HNRNPAB, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPABQ99729 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HNRNPABQ99729 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HNRNPABQ99729 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HNRNPABQ99729 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms