Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBBP8Q99708 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP8Q99708 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP8Q99708 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms