Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EYA3Q99504 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EYA3Q99504 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EYA3Q99504 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EYA3Q99504 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms