Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD180Q99467 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD180Q99467 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD180Q99467 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD180Q99467 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD180Q99467 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD180Q99467 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD180Q99467 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD180Q99467 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD180Q99467 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD180Q99467 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD180Q99467 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD180Q99467 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD180Q99467 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD180Q99467 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD180Q99467 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD180Q99467 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD180Q99467 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD180Q99467 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD180Q99467 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD180Q99467 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD180Q99467 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD180Q99467 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD180Q99467 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD180Q99467 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD180Q99467 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD180Q99467 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD180Q99467 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD180Q99467 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD180Q99467 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD180Q99467 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms