Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBGCP5Q96RT8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBGCP5Q96RT8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms