Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UIMC1Q96RL1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms