Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC85AQ96PX6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms