Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPG4P5Q96PW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPG4P5Q96PW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPG4P5Q96PW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSPG4P5Q96PW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSPG4P5Q96PW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms