Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK3Q96PN8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK3Q96PN8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms