Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAMD11Q96NU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAMD11Q96NU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAMD11Q96NU1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms