Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC115Q96NT0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC115Q96NT0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms