Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF396Q96N95 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF396Q96N95 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms