Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf85Q96MD7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms