Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOLD1Q96LR9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOLD1Q96LR9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOLD1Q96LR9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms