Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP8Q96LD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SENP8Q96LD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP8Q96LD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms