Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RPGRIP1Q96KN7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPGRIP1Q96KN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPGRIP1Q96KN7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms