Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHAMP1Q96JM3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHAMP1Q96JM3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms