Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPD52L3Q96J77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52L3Q96J77 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms