Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC12Q96J65 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCC12Q96J65 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC12Q96J65 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms