Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITCHQ96J02 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITCHQ96J02 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms