Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCD1Q96GM5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCD1Q96GM5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCD1Q96GM5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms