Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP36Q96G28 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP36Q96G28 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP36Q96G28 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms