Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP6Q96FZ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP6Q96FZ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms