Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC97Q96F63 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC97Q96F63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC97Q96F63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms