Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC126Q96EE4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC126Q96EE4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms