Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG4CQ96DT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG4CQ96DT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG4CQ96DT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4CQ96DT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms