Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWCEQ96DN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWCEQ96DN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms