Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ROPN1LQ96C74 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ROPN1LQ96C74 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms