Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TP53INP1Q96A56 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TP53INP1Q96A56 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TP53INP1Q96A56 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TP53INP1Q96A56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms