Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLNQ969V3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLNQ969V3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms