Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKD2Q969F2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKD2Q969F2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms