Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCEAL3Q969E4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCEAL3Q969E4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms