Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAMP4Q969E2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAMP4Q969E2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms