Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLA-CQ95604 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-CQ95604 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-CQ95604 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms