Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX13Q92968 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms