Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNRQ92752 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNRQ92752 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNRQ92752 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNRQ92752 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNRQ92752 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TNRQ92752 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNRQ92752 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNRQ92752 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TNRQ92752 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TNRQ92752 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNRQ92752 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNRQ92752 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNRQ92752 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNRQ92752 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNRQ92752 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TNRQ92752 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNRQ92752 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNRQ92752 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNRQ92752 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNRQ92752 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNRQ92752 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNRQ92752 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNRQ92752 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNRQ92752 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNRQ92752 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNRQ92752 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNRQ92752 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNRQ92752 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNRQ92752 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNRQ92752 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNRQ92752 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRQ92752 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRQ92752 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRQ92752 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRQ92752 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRQ92752 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRQ92752 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNRQ92752 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TNRQ92752 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNRQ92752 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNRQ92752 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNRQ92752 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNRQ92752 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNRQ92752 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNRQ92752 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNRQ92752 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNRQ92752 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNRQ92752 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNRQ92752 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNRQ92752 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNRQ92752 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNRQ92752 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNRQ92752 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TNRQ92752 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TNRQ92752 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRQ92752 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRQ92752 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRQ92752 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRQ92752 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRQ92752 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRQ92752 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TNRQ92752 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TNRQ92752 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNRQ92752 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNRQ92752 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNRQ92752 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TNRQ92752 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNRQ92752 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNRQ92752 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TNRQ92752 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRQ92752 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRQ92752 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRQ92752 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRQ92752 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRQ92752 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRQ92752 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TNRQ92752 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNRQ92752 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNRQ92752 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNRQ92752 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TNRQ92752 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TNRQ92752 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TNRQ92752 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TNRQ92752 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TNRQ92752 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TNRQ92752 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TNRQ92752 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TNRQ92752 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNRQ92752 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNRQ92752 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TNRQ92752 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNRQ92752 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 982.9 ms