Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA1Q92743 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA1Q92743 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA1Q92743 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA1Q92743 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA1Q92743 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA1Q92743 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA1Q92743 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA1Q92743 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA1Q92743 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA1Q92743 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA1Q92743 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA1Q92743 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA1Q92743 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA1Q92743 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA1Q92743 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA1Q92743 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTRA1Q92743 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms