Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF3AQ92664 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF3AQ92664 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3AQ92664 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms