Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDEM1Q92611 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms