Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR4A3Q92570 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NR4A3Q92570 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A3Q92570 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms