Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.95■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CTTNBP2Q8WZ74 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms