Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SREK1Q8WXA9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SREK1Q8WXA9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms