Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT8

SPPL2A, Signal peptide peptidase-like 2A, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2AQ8TCT8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPPL2AQ8TCT8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL2AQ8TCT8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPPL2AQ8TCT8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPPL2AQ8TCT8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL2AQ8TCT8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL2AQ8TCT8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL2AQ8TCT8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms