Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCD1

C18orf32, UPF0729 protein C18orf32, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf32Q8TCD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C18orf32Q8TCD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf32Q8TCD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms