Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA18Q8TC71 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA18Q8TC71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA18Q8TC71 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms